Το ενδιαφέρον του για τη μαγειρική ξεκίνησε ήδη από τα σχολικά του χρόνια, όταν αποφάσισε να παρακολουθήσει το μάθημα της Οικιακής Οικονομίας και πέντε χρόνια αργότερα το έσκασε από την οικογένεια του με προορισμό το Λονδίνο, το μόνο μέρος όπου θα μπορούσε να γίνει μεγάλος σεφ.
Ο ίδιος αποδίδει την τεράστια επιτυχία του στη σκληρή δουλειά, ωστόσο πολλοί υποστηρίζουν ότι τον βοήθησε το γεγονός ότι δούλεψε δίπλα σε διάσημους σεφ όπως ο Μάρκο Πιερ Γουάιτ και ο Νίκο Λαντενίς.
Μία συνεργασία όμως ήταν αυτή που σημάδεψε την καριέρα του: Το 2001 ο Αθερτον άρχισε να δουλεύει για τον εκκεντρικό και αθυρόστομο σεφ Γκόρντον Ράμσεϊ, ενώ είχε συμμετάσχει και σε μερικά από τα επεισόδια του «εφιάλτης στην κουζίνα». Ηταν το δεξί του χέρι για 9 χρόνια και χαρακτηρίζει τον Ράμσεϊ την μεγαλύτερη επιρροή της καριέρας του, αν και φήμες λένε ότι η λήξη της συνεργασίας τους ήταν επεισοδιακή.
Το 2010 ο Αθερτον ξεκίνησε να χτίζει δειλά δειλά την αυτοκρατορία του, ανοίγοντας το πρώτο του εστιατόριο στην Σανγκάη, για το οποίο αναγκάστηκε να υποθηκεύσει το σπίτι του εις διπλούν. Ωστόσο το Pollen Street Social είχε πρωτοφανή επιτυχία κερδίζοντας αστέρι Μισελέν σε λιγότερο από χρόνο.
Μέσα σε τρία χρόνια ακολούθησαν και τα υπόλοιπα εστιατόρια, ενώ πλέον οι συνταγες του Αθερτον φιλοξενούνται σε μεγάλα Βρετανικά έντυπα. Ο ίδιος ωστόσο παραμένει ταπεινός και υποστηρίζει ότι πρώτα σεφ και μετά μάνατζερ, σκέψη που τον βοηθάει να κρατηθεί προσγειωμένος.